美國國防部最新發布的《現代化選擇性採辦報告》顯示，F-35聯合攻擊戰鬥機項目的總採購成本估算已上調至5362億美元，較2023年評估的4852億美元增加了510億美元。這一增長分佈在研發和採購環節，而非單一項目部分。

報告指出，研發、測試與評估費用增加了約190億美元，採購估算則增加了近320億美元。同時，單機生產成本（含發動機）的估算也全面上調。美國空軍的常規起降型F-35A成本上漲7.3%，達到7800萬美元（按2012年美元計算）；海軍和海軍陸戰隊使用的艦載型F-35C上漲6.6%，達到9340萬美元；海軍陸戰隊的短距起飛垂直降落型F-35B漲幅最大，達10.5%，升至1.103億美元。這些歷史美元數據並未披露政府在新生產批次中為各型號支付的實際價格。F-35聯合項目辦公室表示，當前各型號的年度價格屬於受控非保密信息，無法公開。

研發成本目前為1066億美元，項目辦公室指出，這反映了對動力與熱管理升級的修訂估算，該修訂基於更新後的需求和假設。此外，項目還調整了Block 4現代化、發動機核心升級以及動力與熱管理工作的進度安排，增加了數年時間和成本。Block 4是涵蓋武器、傳感器、傳感器融合及其他任務系統的廣泛現代化包，項目正優先推進55項能力，包括制空和壓制敵方防空任務的殺傷鏈改進，以及新武器集成。

採購成本的增長則與生產後期型號的壓力直接相關。項目辦公室提到，即將生產的APG-85雷達、更高的生產支持費用、動力與熱管理升級要求，以及承包商的實際成本和第18、19批次的談判定價。2025年9月，五角大樓與洛克希德·馬丁公司敲定了242.9億美元的協議，採購這兩個批次的296架飛機。普惠公司和項目辦公室在4月宣佈的發動機協議總價值66億美元，飛機與發動機合併後，所有型號的隱含平均成本約為1.044億美元。

通貨膨脹和材料價格上漲給項目帶來了額外壓力。軍方還計劃將部分F-35採購推遲到當前預算週期之外，這意味著這些飛機在簽約前將面臨更多通脹影響。海軍陸戰隊正在調整其採購組合，將部分F-35B採購轉為艦載型F-35C，由於替代的F-35C將比原計劃的F-35B購買時間更晚，項目辦公室預計通脹和維護成本將推高總估算。

儘管成本上升，五角大樓仍將F-35描述為一個“成熟的企業”，目前有1200多架飛機在20個國家運營。報告提到，該項目於2024年3月進入全速生產階段，並部署了技術更新3硬件，為Block 4奠定了基礎。五角大樓在報告中表示：“日益增長的全球需求不言自明。F-35的價值主張無與倫比。”項目目前正專注於長期能力改進和降低不斷擴大的機隊的維持成本。洛克希德·馬丁公司發言人米雷婭·維拉雷亞爾表示，最新報告顯示F-35項目已進入全速生產，恢復高產量交付並實現全球增長。